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생물학 2

[생물학] TGF beta signaling pathway 에 대한 정리

1. TGFβ 란?- transforming growth factor beta (TGFβ) - 한국어로 "변형 성장 인자 베타" 라고 할 수 있을 듯- 세포 성장, 분화, 이동, 사멸, 항상성, 기타 기능 등에 대한 세포 과정에 관여- 1983년에 혈소판 유래 성장인자와 (platelets derived growth factors, PDGF) 상피성장 인자(epidermal growth factors, EGF, TGF-α)를 연구하던 과학자들이 있었고, 그들이 TGF-Beta가 섬유 아세포(fibroblasts)를 변형시키는 능력을 확인하며 발견됨.- T세포의 subset에 의해 주로 생성되는 세포외 단백질임 2. TGFβ 경로 과정- 1) TGFβ superfamily ligand가 Type II re..

생물학 2024.10.22

Hi-C란? (개념, 실험적 단계, 분석적 단계, 분석 원리, 데이터 해석)

1.  Hi-C란? Hi-C 는 chromatin conformation(크로마틴의 형태)를 포착(capture)하기 위한 기술을 의미한다.cf) 3C: chromatin conformation capture의 약칭이다.cf) DNA가 구부러지듯이 promoter와 enhancer가 상호작용 하는 경우를 생각해보자. 3C 기술은 이와 같은 선형적인 염기서열에서는 멀리 떨어져 있는 부위지만 공간 상으로 가까이 위치하게 되어 두 부위가 얼마나 interaction을 하고 있는지, 그  강도를 정량화 할 수 있는 기술이다.Hi-C는 NGS와 3C의 접근 방식을 결합하여 게놈 전반에 해당하는 크로마틴 상호 작용을 종합적으로 감지할 수 있는 기술이다.2.  Hi-C 실험의 일반적 단계1) 포름알데이드를 통한 cr..

생물학 2024.09.27
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